大会举行了第二次全体会议。大会执行主席方伟、马士光、王加培、胡建军、卢刚、尹哲强、黄远征、王先桥、李振峰、杨新忠、林小异、赵云燕、王东升在主席台前排就座。省委组织部换届工作督导组组长李健到会指导。
会议应到代表443人,实到代表426人,符合规定人数。
第二次全体会议举行了两场选举。会议首先通过了《中国共产党连云港市第十三次代表大会选举办法》。会议以无记名投票方式进行了差额选举,51名同志当选为中国共产党连云港市第十三届委员会委员,9名同志当选为中国共产党连云港市第十三届委员会候补委员,31名同志当选为中国共产党连云港市第十三届纪律检查委员会委员,39名同志当选为连云港市出席中国共产党江苏省第十四次代表大会代表。
大会通过了《中国共产党连云港市第十三次代表大会关于中共连云港市第十二届委员会报告的决议》和《中国共产党连云港市第十三次代表大会关于中共连云港市第十二届纪律检查委员会工作报告的决议》。